انحلال صندوق به پيشنهاد شوراي توسعه فرهنگ قرآني و تصويب شوراي عالي انقلاب فرهنگي خواهد بود. در صورت انحلال، کليه اعتبارات موجود در صندوق به خزانه واريز و کليه اسناد و امکانات آن به دبيرخانه شوراي توسعه فرهنگ قرآني باز ميگردد.