رئيس پژوهشكده از ميان اعضاء هيأت علمي جهاد دانشگاهي به پيشنهاد رئيس جهاد دانشگاهي و با تأييد هيأت امناي جهاد دانشگاهي و با حكم رئيس جهاد دانشگاهي منصوب خواهد شد.