ماده11ـ وظايف و اختيارات شوراي پژوهشگاه:

1ـ بررسي و پيشنهاد سياستها و برنامه‌هاي پژوهشگاه جهت سير مراحل تصويب.
2ـ بررسي و تصويب آئين‌نامه‌ها و دستورالعملهاي آموزشي و پژوهشي.
3ـ بررسي و تائيد شرح فعاليتهاي تخصصي گروههاي پژوهشي.
4ـ بررسي و تصويب طرحهاي پژوهشي و ناظران آنها و نظارت بر كيفيت و حسن اجراي طرحهاي مزبور و در صورت لزوم تجديدنظر و تصويب تغييرات.
5 ـ تعيين داور يا هيئت داوران طرحهاي پژوهشي، كه از سوي معاون مطالعات و تحقيقات پژوهشگاه پيشنهاد مي‌شوند.
6 ـ ارزيابي نتايج فعاليتهاي پژوهشگاه و اتخاذ تصميم درخصوص بهبود و توسعه‌ي فعاليتها در چارچوب اختيارات شورا.
7ـ بررسي و پيشنهاد تاسيس يا تغيير گروههاي پژوهشي و تخصصي جهت سير مراحل تصويب به ستاد كل.
8 ـ بررسي و پيشنهاد برگزاري بورسهاي تحصيلي، فرصتهاي مطالعاتي، همايشها و بازديدهاي علمي و تصويب مفاد برنامه‌هاي دوره‌هاي آموزشي.
تبصره ـ چنانچه به پژوهشگاه مجوز برگزاري دوره‌هاي طولي داده شود برنامه و سرفصلهاي آن بايد به تاييد مراجع ذيصلاح در نيروهاي مسلح (معاون نيروي انساني ستاد كل نيروهاي مسلح) و كشوري نيز برسد.
9ـ بررسي و تصويب دستورالعمل مربوط به تدوين، تاليف و ترجمه كتب و مقاله و نحوه انتشار نتايج فعاليتهاي پژوهشي پژوهشگاه در چارچوب مصوبات هيئت‌امناء و مقررات بنياد حفظ آثار و ارزشهاي دفاع مقدس.
10ـ بررسي و تاييد صلاحيت علمي متقاضيان عضويت در هيات علمي پژوهشگاه مطابق مقررات هيات‌هاي علمي در كشور و نيروهاي مسلح.
11ـ اجراي ساير اموري كه در چارچوب ضوابط و مقررات، از سوي هيئت‌امناء پژوهشگاه و رئيس پژوهشگاه به اين شورا محول مي‌شود.