ماده 9ـ وظايف و اختيارات رئيس مؤسسه:

1ـ ادارة ‌كلية امور مؤسسه.
2ـ اجراي مصوبات مديريت حوزة‌ علمية قم و هيئت امنا.
3ـ تهيه و تنظيم و پيشنهاد بودجة سالانة مؤسسه به هيئت امنا براي تصويب.
4ـ استخدام، انتصاب و عزل كاركنان مؤسسه با رعايت ضوابط، مقررات و آيين‎نامه‎هاي مؤسسه.
5ـ انعقاد قرارداد با اشخاص حقيقي و حقوقي.
6ـ امضاي كلية اسناد مالي و غيرمالي و اوراق بهادار و تعهدآور براي مؤسسه.