ماده 3ـ
هيأت وزيران در اجراي اين قانون، مسؤوليتهاي زير را نيز برعهده دارد:
الف ـ تعيين و يا تغيير سازمان مسؤول منطقه اعم از دولتي و غيردولتي.
ب ـ نظارت بر فعاليتهاي مناطق در چارچوب برنامهها و اهداف آنها.
تبصره1ـ هيأت وزيران ميتواند درصورت نياز، سازماني دولتي را به منظور اداره منطقـه ويژه ايـجاد نمايد. اساسنـامه اين سازمانها بنا به پيشنهاد دبيرخانه به تصويب هيأت وزيران ميرسد.
تبصره2ـ تعيين سازمان مسـؤول منطقه از بين اشخـاص حقوقي غيردولتي منوط به تملك (يا واگذاري رسمي دستگاههاي دولتي ذيربط) و تصرف اراضي واقع در محدوده منطقه ويژه موردنظر توسط اشخاص حقوقي غيردولتي، قبل از صدور مجوز هيأت وزيران ميباشد. ضابطه تغيير سازمان مسؤول منطقه در چنين صورتي تابع قراردادي ميباشد كه با رعايت اين قانون فيمابين دبيرخانه و سازمان منعقد ميشود.