رييس سازمان به عنوان معاون وزير آموزش و پرورش و مسئول حُسن اجراي كليه امور سازمان ميباشد و براي اداره امور سازمان و نحوه اجراي مصوبات شوراي سازمان داراي حقوق و اختيارات قانوني است.