شوراي عالي هواپيمايي كشوري در اولين جلسه از بين اعضاي يكنفر رييس و يك نفر نايب رييس براي مدت يكسال انتخاب خواهد نمود كه تجديدانتخاب آنها بلامانع است. در غياب رييس شورا اداره جلسات با نايب رييس است.
