سازمان مديريت و برنامه ريزي کشور موظف است برنامه توسعه مناطق آزاد و ويژه را در دو بخش آمايش سرزمين و همچنين برنامه چهارم توسعه کشور به عنوان يک بخش مستقل درنظرگيرد.