شهرستان هنديجان به مرکزيت شهر هنديجان از ترکيب بخشهاي زير ايجاد و تاسيس گردد:الف ـ بخش مرکزي به مرکزيت شهر هنديجان شامل دهستانهاي هنديجان شرقي و هنديجان غربي.ب ـ بخش چم خلف عيسي.