چنانچه به هر علتى مركز قادر به ادامه خدمت و فعاليت نباشد، با تصويب هيأت امنا و تأييد مقام معظم رهبرى منحل مىشود، و سه نفر به عنوان هيأت تصفيه از سوى هيأت امنا انتخاب مىگردند.
هيأت تصفيه وظايف زير را دارا است: ـ 1تعيين تكليف طلابى كه در مدارس تحت پوشش مركز به تحصيل مشغول هستند. ـ 2دريافت مطالبات و پرداخت ديون و قراردادن اموال مركز دراختيار دفتر مقام معظم رهبرى تا به هر نحوى كه صلاح دانستند اقدام نمايند.